- Πανεπιστημιακό Κέντρο Διεθνών Προγραμμάτων Σπουδών (ΠΚΔΠΣ ΔΙΠΑΕ, το πρώην ΔΙΠΑΕ) – με έδρα Θεσσαλονίκη και με προγράμματα σπουδών 1ου, 2ου και 3ου κύκλου σε ξένη γλώσσα.
- Πανεπιστημιακό Ερευνητικό Κέντρο (ΠΕΚ ΔΙΠΑΕ) – με 9 Ερευνητικά Ινστιτούτα
- Ινστιτούτο Επιστημών Ζωής (Θεσσαλονίκη)
- Ινστιτούτο Πετρελαίου (Καβάλα)
- Ινστιτούτο Τουρισμού και Φιλοξενίας (Καβάλα)
- Ινστιτούτο Αστικού Περιβάλλοντος (Σέρρες)
- Ινστιτούτο Κοινωνικής και Αλληλέγγυας Οικονομίας (Θεσσαλονίκη)
- Ινστιτούτο Διαχείρισης Προσφυγικών Ροών και Κρίσεων (Θεσσαλονίκη)
- Ινστιτούτο Αγροτικής Βιομηχανίας (Θεσσαλονίκη)
- Ινστιτούτο Βιομηχανικής Καινοτομίας και Ψηφιακής Γεωργίας (Σέρρες)
- Ινστιτούτο Βιώσιμης Ανάπτυξης και Κυκλικής Οικονομίας (Κατερίνη)
Ινστιτούτο Εκπαιδευτικής Έρευνας και Ανάπτυξης
Κέντρο Δια Βίου Μάθησης
